原来，圣玛丽亚德教堂是个世界闻名的“人骨教堂”，里面用一万多具男女修士的骨头作装饰。本来，这里平时很少对外开放，但近年来，一些年轻人为了追求刺激和留下深刻记忆，开始在这里举行婚礼，不料新人们在这里接二连三地遭遇鬼魅。难道世上真的有鬼魂？那些鬼魂到底是什么？
新娘吓疯
塞格尔是意大利罗马大学生物学教授，他的女儿海伦娜是个芭蕾舞演员。3年前，罗马市政府秘书劳伦斯跟着塞格尔读在职博士研究生，爱上了海伦娜，开始疯狂地追求她。
劳伦斯虽然出身普通家庭，但他好学上进，人也长得不错，所以海伦娜答应了他的求爱。但是，此后劳伦斯几次提出要跟海伦娜结婚，都被她婉言拒绝了，她想等两年再说。对一个芭蕾舞演员来说，一旦结婚，艺术生涯也就结束了。
2010年10月1日，海伦娜终于答应嫁给劳伦斯了，两个人在一起商量在哪举行婚礼时，劳伦斯说：“我的好几位朋友都选择在圣玛丽亚德教堂举行婚礼，他们说在那里举行婚礼，既有意义，又新鲜刺激，还能留下终身难忘的记忆。我们是不是也在那里举行婚礼？”
海伦娜吃了一惊，她虽然时常听说圣玛丽亚德教堂的事，但连一次都没敢进去过。因为这个教堂已经有400多年历史了，当地男女修士们认为，死后将尸身献给上帝是对上帝的赞美和无上光荣的事，教堂是灵魂最好的归宿，所以都愿意死后把遗骨献给教堂。后来，因为遗骨太多，实在放不下，神父们就用人的尸骨做成教堂的各种装饰，先后用掉一万多具人的尸骨。
想想那种地方就让人毛骨悚然，海伦娜有些犹豫：“听说那里有时闹鬼……”劳伦斯说：“有我在，闹鬼怕什么？再说闹鬼更刺激！”想到自己因为事业，到现在才答应跟劳伦斯结婚，有些亏欠他，海伦娜还是答应了。
他们将婚礼定在11月1日举行，由于11月1日也是罗马天主教的万圣节，就是鬼节，是修士们祭奠先圣的日子。所以劳伦斯和海伦娜的婚礼，要等修士们祭奠后才能举行。等修士们祭奠后离开，再做做准备，已经是傍晚时分了。
海伦娜第一次走进这个教堂，面对堆积如山的人骨，特别是悬在墙上的头骨黑而空洞的眼窝注视着自己，海伦娜紧张得汗毛孔都张开了。
婚礼按正常的程序进行，一切都很顺利。婚礼结束的时候，海伦娜在伴娘的陪伴下，走进教堂侧室，准备补一下妆然后陪着大家去婚宴现场，其他人都在外面等着。然而，就在海伦娜走进教堂侧室仅3分钟后，忽然从侧室里传出一阵尖叫，接着，海伦娜和两个伴娘全都披头散发衣冠不整地跑了出来，一边跑一边大喊救命。大家想拦住她们问问是怎么回事，但三个女孩都像疯了一样，谁拦就抓谁咬谁。海伦娜跑回家后，一头栽倒在地，昏死过去。大家手忙脚乱地把她弄醒，海伦娜已经目光呆滞，嘴里一直胡言乱语。
海伦娜精神失常了。
父亲卧底
事后，一个伴娘在清醒过来后才告诉大家实情：当时，海伦娜正在教堂侧室里换衣服，忽然，侧室里的灯开始忽闪忽灭，接着从屋梁上传来一声凄厉的尖叫。惊魂未定的三个人抬头一看，只见有一个龇牙咧嘴的恶鬼正睁着一双空洞洞的眼睛盯着她们狞笑，然后怪叫一声向她们扑来，在她们的头上脖子上乱抓，她们唯一能做的就是赶快逃命。
海伦娜的父亲塞格尔仔细检查了海伦娜和伴娘的头部，发现在她们的头皮和脖子上，的确留有什么东西抓过的痕迹：如果伴娘的话是假的，这些痕迹是怎么回事？如果她的话是真的，难道人骨教堂真的有鬼？塞格尔不相信世上有鬼，咬着牙说：“要想治好海伦娜的病，就必须找到病根，我倒要亲眼看看海伦娜到底遇到了什么鬼！”
劳伦斯却表示反对，他劝岳父说，听说人骨教堂到了晚上，有些冤死的骷髅会复活，他们从墙上纷纷爬下来，踩着其他骷髅的骨头，发出吱吱作响的声音，然后狂欢，有的还会跳到柱子上荡来荡去，如果这时有人打扰他们，就会受到攻击：“都怪我们的婚礼办得晚了，打扰了那些冤魂。我看还是先把海伦娜送到医院再说吧。”
塞格尔不答应，教堂的马休神父和塞格尔是中学同学，他早就想搞清楚教堂闹鬼到底是怎么回事了，表示愿意跟塞格尔一起住进那间侧室仔细观察研究。
那间侧室只有十几个平方米，窗框、门框和神像的四周都镶着用人骨做的装饰，特别是头顶上那个吊灯，是用人的头骨做成，灯泡装在头骨里面，显得陰森而恐怖。但因为有马休神父陪着，塞格尔也是个无神论者，所以他并不害怕。
然而，两人住进教堂几个晚上，什么异常情况也没发生。第六天晚上，马休神父先睡了。塞格尔有个睡前翻杂志的习惯，他靠在床上看杂志。忽然，屋梁上传来一阵陰森森的窃窃私语和偷笑声，接着灯灭了。但塞格尔的眼睛还没适应过来，灯又亮了起来。就在这灯光闪烁之间，塞格尔清楚地看到屋梁上慢慢爬起一个骷髅人，只见他咧着嘴狞笑着，两只黑洞洞的眼窝里闪着绿光，灯光每闪一次，他就往下爬一点，他的骨头碰到柱子上发出咚咚的轻响。
塞格尔开始毛骨悚然：原来世上真的有鬼！他连忙去喊马休神父，马休神父也被眼前的情形吓蒙了，“扑通”一声跪在地上祷告。就在这时，灯光完全灭了，夜色中，只见那个骷髅人已经下到了地面，开始一步一步地向他们走来。
塞格尔害怕了，他悄悄地站了起来，轻轻踢了马休神父一脚，小声地说：“我喊一二三，我们得赶快跑！”
不料他的话刚说完，就听那骷髅人一声怪叫，塞格尔感觉一股陰风向自己扑来，他还没迈开腿，就感到已经有东西扑到了他的身上，在他的头上脖子上撕扯起来。塞格尔和马休神父一边抵挡一边往门外退，退到门口时，他们连忙关上门。骷髅鬼还不甘心，在门里面又嘎吱嘎吱地抓了一会儿，才慢慢没了动静。
两人好半天才喘了口气，这才发现身上全都汗透了。但是，塞格尔仔细一想，又觉得有问题：刚才明明只看到有一个骷髅鬼，为什么自己和马休神父都受到了攻击？还有，当自己受到骷髅鬼攻击时，他明明是一副骷髅，自己为什么隐约记得攻击自己的鬼有肉还有毛？
塞格尔把自己的怀疑说了出来，马休神父也回想起来了，攻击他的骷髅鬼似乎也有肉身和毛发，他的手上甚至还沾着一些细细的毛发，但他还是不明白：“可是，我们亲眼看到那个骷髅鬼从墙上爬下来的，还有当时只有我们两个人，为什么灯会忽明忽灭？而且我也听到了骷髅鬼的窃笑，那么陰森。”塞格尔说：“我不敢再进去了，明天再说吧。”
第二天，塞格尔再次来到教堂，仔细观察后，他让马休神父找来一架长长的梯子，然后爬上了屋梁。这时，劳伦斯也来了，他劝岳父赶快下来。塞格尔没理他，在屋梁上观察了半天后，对马休神父说：“我明白了，马休，今天晚上看我把鬼捉给你看！”
原来，通过仔细观察，塞格尔发现，在这个古老教堂的屋梁上，竟然几乎没有灰尘。在屋梁的尽头，有一个老式按钮式电线开关，可能是当初教堂做照明改造时临时用于控制电源的，后来忘了拆掉，他伸手按了一下开关，它控制的正是教堂侧室的灯。在开关的一侧，有一个直径只有十几厘米的小洞，可以通往教堂的屋顶。如果有谁想从屋梁的这一头通过小洞钻到屋顶上，必须得路过那个开关。塞格尔在开关的旁边，发现有一只小小的动物脚印，趴下去一闻，还有一股臊臭味。
他顿时明白了：当地很多老建筑物中，都生活有一种名叫鼬的小动物，体重有一公斤多，非常聪明灵活，它们以老鼠和在屋顶过夜的麻雀为食，所以老百姓都喜欢它们：一定是有一群鼬经常从屋梁穿过去屋顶捉麻雀，正好踩在了按钮开关上，由于它们不止一个，每踩到一次，灯就会忽明忽暗一次，这就是教堂闹鬼的原因。
真鬼假魅
但是，马休神父还是不明白：“骷髅变成鬼是怎么回事？那可是我们亲眼看到的，还有攻击我们的是什么？我们的头和肚子上的抓痕还在呢！”塞格尔说：“这也正是我想搞清楚的事，不过我已经有了怀疑，只不过还需要验证。”马休神父问：“你怀疑什么？”塞格尔说：“在没有证据前我不会说的，但你很快就会知道事情的真相了。”
经医院诊治，海伦娜的病情慢慢稳定了下来，但还是不太正常，睡觉时必须开着灯，还经常被惊醒，然后大叫：“有鬼，有鬼！”心病还需心药治，像海伦娜这种因惊吓发作的精神方面疾病，必须找到病根，揭开事实真相，否则就算病治好了，她心里的陰影也永远不会消除。
在劳伦斯的陪同下，塞格尔想带着女儿再去教堂，把鼬闹鬼的真相告诉她，但她无论如何也不敢走进教堂。塞格尔只好在外面地上一边画一边把鼬是如何闹鬼的事一点一点说给女儿听。但海伦娜一边听一边摇头不相信。劳伦斯劝岳父说：“既然她不相信就算了，以后再也不让她来这里了。”塞格尔看了女婿一眼，什么也没说。
其实，那天塞格尔爬到教堂的屋梁上，还发现了一个秘密，就是不知什么人用极细的钢丝把一副人的骨架连接了起来，不仔细看根本看不见。钢丝的一头连接在屋梁上，并设了一个小小的机关，如果有鼬路过，那副骨架就会慢慢从屋梁上放下，就像人的骨架变成了骷髅鬼爬下来一样。他还怀疑攻击自己和马休神父的，并不是骷髅鬼，而是那些鼬，但鼬为什么会攻击人呢？还有，是什么人把人骨架串起来的？他想干什么？塞格尔怀疑这一切都是劳伦斯干的，但他为什么要这样做？再说，自己连一点证据也没有啊！所以他谁都没告诉。
塞格尔一边给女儿治病，一边开始悄悄地调查劳伦斯。通过调查，劳伦斯的朋友们很快就把人骨架变鬼的秘密说了出来。原来，几个月前，一个朋友要在人骨教堂举行婚礼，劳伦斯和几个朋友一起，决定捉弄一下新郎和新娘，他们把一副人骨架用细钢丝串了起来，趁新娘换衣服时悄悄地把骨架放了下来，结果把新娘吓了个半死，大家觉得非常开心。
塞格尔继续调查，结果他意外地发现，由于海伦娜一直没有同意跟劳伦斯结婚，劳伦斯竟爱上了一个名叫梅伊的女孩，并让梅伊怀了孕！另外，塞格尔还发现，劳伦斯竟然学会了吸毒！会不会因为这个事，劳伦斯想吓死海伦娜？但他又是用什么手段让鼬攻击人的呢？塞格尔实在理不清头绪，他决定报案。
3天后，警方将正在吸毒的劳伦斯抓了个正着，当即以吸毒的罪名拘捕了他。因为劳伦斯有毒瘾，警方不让他吸毒，他很快就交代了事情的原委。
原来，的确像塞格尔调查的那样，因为海伦娜一心想跳舞，不仅几年都不跟劳伦斯结婚，平时连跟他亲热都十分保守，慢慢地，劳伦斯开始移情别恋，爱上了一个名叫梅伊的女孩，并让她怀了孕。
但是，海伦娜的父亲塞格尔是他的导师，他还没拿到博士学位，他不敢提出跟海伦娜分手，生怕得罪了导师无法毕业。想到海伦娜天性胆小，他决定用自己曾经参与的用人的骨架变骷髅鬼吓坏新娘的办法，来吓唬海伦娜，因为海伦娜的胆子特别小，他觉得就算吓不死她，也会把她吓成精神病，这样自己就有理由跟她分手了。
为了把事情做得更有把握，他甚至想到了一个更加陰毒的办法：趁着到教堂参加别人婚礼的机会，悄悄地给那些鼬喂食毒品，等它们上瘾后，再训练它们到人的身上来找。结果那些鼬犯了毒瘾后，只要看到有人进了侧室，就会疯狂地扑上来找毒品，如果找不到，它们就疯狂地撕咬，那些窃窃私语声，实际上是鼬的叫声……
得知教堂闹鬼的真相后，海伦娜惊得目瞪口呆，好半天她才清醒过来，愤怒地说：“这个劳伦斯，只要他告诉我他有毒瘾，我就会主动跟他分手，哪要他这样做？这下可好，真是害人又害己！他就是那个真正的鬼魅！”